RNA-seqを再考、捉えにくいトランスクリプトームを明らかに

ユニークな遺伝子発現リードを取得し、RNAシークエンスの成功を最大化しましょう

非常に大量のリボソームRNA（rRNA）が、遺伝子発現やトランスクリプトミクス研究の感度に影響を与え、リードの無駄やRNAシークエンスコストの増加につながっていませんか？ 

QIAseq FastSelect技術を用いて、不要なrRNAを95%以上、効率的にワンステップで除去できます。哺乳類、植物、酵母や細菌RNAサンプル、高品質の、あるいは分解したRNAサンプル、FFPE RNAサンプルのいずれを扱う場合でも、QIAseq FastSelectは、RNAシークエンスを一変させ–、Ribo-Zero、RiboErase、RiboMinusを上回るパフォーマンスを発揮します。

高品質ストランドRNAシークエンスライブラリー調製によるトランスクリプトーム詳細の解明

使用可能なRNAシークエンスリードを最大にし、少量の転写産物の検出感度を達成し - ライブラリー調製にかかる時間を44%短縮したいですか？

QIAseq FastSelect rRNA除去技術の効率とQIAseq Stranded RNA Library Kitsのストランド特異性を組み合わせています。QIAseq FastSelectを用いて、RNAシークエンスワークフローを開始し、わずか14分で95%以上のrRNAまたはグロビンmRNAをワンステップで除去します。次に、アクチノマイシンDとdUTP処理なしで機能するQIAseq Stranded RNA Library Kitsを使用して、鎖状で高品質のIllumina対応RNAシークエンスライブラリー調製に進みます。 統合されたRNA-seq Analysis Portalを使用して、ストランドRNAシークエンスデータを容易に解析できます。これは、生物学者向けに作成された直感的なウェブベースのデータ解析ソリューションで、今はQIAseq Stranded RNA Library Kitsに含まれています。

ハイスループット、低インプットの3’ RNAシークエンスおよび完全なトランスクリプトームRNAシークエンス

RNAの量が限られているため、遺伝子発現の洞察を最大限に高める能力が制限されていませんか？ 多くのRNAシークエンスワークフローでは、低スループット機能しか提供されず、大量のサンプルインプットを必要とします。rRNAのコンタミネーションはリソースと時間を無駄にし、最終的にはオンターゲットリードを捕捉する能力に影響をもたらす可能性があります。新しいQIAseq UPXome RNA Library Kitは、このような障害を克服するのに役立ちます。この汎用性の高いライブラリー調製キットが、断片化された低インプットRNAサンプルを用いる3’ RNAシークエンスと完全なトランスクリプトームRNAシークエンスの両方にどのように使用できるのかご覧ください。cDNAのウルトラプレックスプールにより、廃棄物を90%以上削減しながら、スループットを簡単に向上させます。

ハイスループットmiRNAシークエンス技術を使用した疾患研究におけるmiRNAの役割を解読

miRNAプロファイリングは、多数の疾患についての興味深い洞察を明らかにします。しかし、バイオフルイドサンプルを扱っている場合、少ないRNA量と高いレベルの阻害物質が一般的に問題となります。わずか1 ngのトータルRNAインプットに対応したゲルフリーmiRNAシークエンスソリューションを使用して、サンプルの変動に伴う課題を排除し、miRNA発現差を探求してください。パターン化したフローセルを使用するIllumina NovaSeqや他のNGS機器に対応する768のunique dual indx（UDI）を含んだQIAseq miRNA 96 Index Kit UDI A–H（768）を使用して、ランするサンプル数を増やし、シークエンシングコストを削減し、シークエンシングデータの信頼性を高めてください。統合された RNA-seq Analysis Portal –を使用すると、miRNAシークエンスデータを容易に分析し、新たな疾患の洞察を得ることができます。このポータルは、生物学者向けに作成された直感的なWebベースのデータ分析ソリューションであり、今は、QIAseq miRNA Library Kits.に含まれています。

低インプットRNAシークエンスの課題を克服する

低インプットRNAライブラリーの調製には大きな問題が生じる可能性があります。ワークフローの各ステップでは、RNAがさらに失われる可能性があります。多くの場合、384を超えるサンプルを同時にランしたり、小分子またはCRISPRスクリーニングを行うために必要なNGSライブラリー調製量を達成したりすることは不可能かも知れません。当社は、このような課題を簡単に解決できるようお手伝いいたします。新しいQIAseq UPXome RNA Library Kitを使用して、サンプル数、リード予算、シークエンシングプラットフォームに基づいてワークフローをカスタマイズする方法をご確認ください。3’ RNAシークエンス、あるいは完全なトランスクリプトームRNAシークエンスに関心がおありですか？ このような多用途キットを使用すると、両方行うことができます。

シングルセルと最小限のRNA量からのトランスクリプトームの洞察を最大化する

シングルセルや限られたRNAサンプルだからといって、必ずしもトランスクリプトームに対する見解が限定されるわけではありません。当社のシングルセルRNAライブラリーキットが、分離した細胞から、NGSに対応する高度に複雑なライブラリーをわずか5.5時間でもたらす方法をご覧ください。最適化したケミストリーとPCRフリープロトコールにより、バイアスの問題を解消します。

ひとつのアッセイでRNA融合、遺伝子発現、SNVに関する洞察を獲得

QIAseq RNA Fusion XP Panelsを使用して、RNA融合検出、遺伝子発現プロファイリング、SNV分析をひとつのアッセイに組み合わせて、重要なバイオマーカーについて包括的な見解を取得します。合理化された低インプットワークフローにより、優れた感度を実現し、偽陽性を削減します。 使いやすいカスタムビルダーを使用して、目的の領域をターゲットにするカスタムパネルを設計することも可能です。

デジタルRNAシークエンスルートを利用して融合遺伝子と発現解析を行う

ターゲットRNAシークエンスを用いて遺伝子発現の変化をモニタリングしたり、融合遺伝子や変異の同定を検討している場合、ライブラリ―調整やNGS解析中の課題は、最適とは言えない結果につながります。PCRバイアスやシークエンシングアーチファクトはデータの感度を損なう可能性があります。RNAシークエンスアプリケーション用の当社のQIAseqパネルは、精度、正確性、カバレッジを向上させるためにsingle primer extension（SPE）とunique molecular index（UMI）技術を利用しているため、従来のRNAシークエンスの限界を克服し、バイアスを低減することができます。統合されたデータ解析パイプラインにより、RNAシークエンスデータの生成から洞察の蓄積への飛躍がかつてないほど容易になりました。

RNAシークエンスデータ分析の障害を克服する

RNAシークエンスデータの意味を理解するのに苦労していませんか？ 当社にはまさにその解決策があります！ QIAseq RNAライブラリーとFastSelect Kitsには、データ解析を簡素化するために生物学者向けに作成された直感的なWebベースのソリューションであるRNA-seq Analysis Portal–への無償アクセスが含まれています。GeneGlobeと完全に統合されたRNA-seq Analysis Portalでは、RNAシークエンスデータ生成から遺伝子発現の洞察獲得までをシームレスに行うことができます。

2021 QIAGEN RNA-seq助成金を受けた方々に会いましょう

2021年に当社は、QIAGEN RNA-seq助成金を申請して、自身の研究のためにRNA-seqの可能性を引き出しましょうと研究者の方々に提案いたしました。すると驚いたことに、2400人の方々から申請があり、実際に助成金を受ける方々を発表する運びとなり、大変光栄に感じております。